Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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