Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD6O43541 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms