Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COCHO43405 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COCHO43405 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COCHO43405 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COCHO43405 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COCHO43405 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms