Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms