Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJD2Q9UKL4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms