Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GGA1Q9UJY5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms