Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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