Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX3Q9UBR4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX3Q9UBR4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms