Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL13Q9P2N7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms