Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms