Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA4BQ9NPR2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms