Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FYCO1Q9BQS8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms