Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDHCQ99643 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms