Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms