Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms