Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD35Q8N283 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD35Q8N283 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms