Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms