Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms