Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD2Q6Y1H2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms