Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms