Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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