Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME3Q16798 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME3Q16798 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME3Q16798 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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