Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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