Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR3Q13615 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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