Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LTBQ06643 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBQ06643 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBQ06643 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms