Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms