Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms