Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms