Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFDNP55196 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AFDNP55196 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AFDNP55196 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AFDNP55196 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AFDNP55196 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms