Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMP3P54852 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMP3P54852 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms