Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRCA2P51587 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms