Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms