Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms