Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA1P29973 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms