Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms