Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DPA1P20036 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms