Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAV1P15498 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAV1P15498 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAV1P15498 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAV1P15498 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAV1P15498 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAV1P15498 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms