Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA4P06727 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA4P06727 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA4P06727 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA4P06727 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms