Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APODP05090 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APODP05090 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APODP05090 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APODP05090 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APODP05090 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APODP05090 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APODP05090 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APODP05090 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APODP05090 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APODP05090 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms