Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT4O95628 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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