Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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