Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms