Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms