Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF2Q9Y5W3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms