Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms