Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT6Q9ULM6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms