Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIMD1Q9UGP4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIMD1Q9UGP4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms