Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED17Q9NVC6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms