Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A13Q9NSD5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms