Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms